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気候は県内全域が太平洋側気候に属し温暖だが、冬と夏で寒暑の差が激しい。
熊本地方の熊本市周辺では年平均気温が16℃以上あり、温暖である。有明海に面しているため瀬戸内海式気候に近い。夏場では気温が35℃を越す猛暑になることも少なくない。冬では最低気温が氷点下まで下がることもあるが、降雪や積雪は少ない。
阿蘇地方は山地型気候で、九州随一の寒冷地である。冬は九州山地や阿蘇山では毎年多量の積雪となるが、中国地方以東とは対照的に豪雪地帯には指定されていない。最低気温も氷点下まで下がることが多く、真冬日にもなりやすい。寒気が流れ込むと山頂では稀に-20℃程度の極寒となり、厳寒となる。 夏では熊本市周辺が35℃以上の猛暑でも、25℃以下の気温が続き冷涼な気候である。阿蘇山では最高気温が30℃に達することが全く無い。降水量も多く年間を通して2,000mm以上と多雨である。


熊本県の気象データ
| 要素 |
降水量
(mm) |
気温
(℃) |
日照時間
(時間) |
| 合計 |
平均 |
最高 |
最低 |
合計 |
| 統計期間 |
1971
~2000 |
1971
~2000 |
1971
~2000 |
1971
~2000 |
1971
~2000 |
| 資料年数 |
30 |
30 |
30 |
30 |
30 |
| 1月 |
60.4 |
5.4 |
10.3 |
0.8 |
130.2 |
| 2月 |
77.5 |
6.5 |
11.4 |
1.7 |
133.6 |
| 3月 |
134.4 |
10.1 |
15.4 |
5.0 |
157.6 |
| 4月 |
157.7 |
15.5 |
21.1 |
10.0 |
177.0 |
| 5月 |
185.8 |
19.7 |
25.1 |
14.5 |
186.1 |
| 6月 |
434.7 |
23.2 |
27.7 |
19.3 |
136.7 |
| 7月 |
376.4 |
27.0 |
31.4 |
23.6 |
186.6 |
| 8月 |
182.2 |
27.7 |
32.6 |
23.9 |
207.0 |
| 9月 |
176.8 |
24.1 |
29.0 |
20.0 |
167.1 |
| 10月 |
86.1 |
18.5 |
24.1 |
13.5 |
184.2 |
| 11月 |
71.4 |
12.7 |
18.3 |
7.6 |
151.8 |
| 12月 |
49.4 |
7.4 |
12.8 |
2.5 |
146.8 |
| 年 |
1992.7 |
16.5 |
21.6 |
11.9 |
1964.5 |
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